A la Gerencia Regional de Planeamiento, Presupuesto y Acondicionamiento Territorial le corresponde ejercer las funciones específicas sectoriales en materia de planificación estratégica prospectiva, inversiones, presupuesto, tributación y ordenamiento territorial, administración y adjudicación de terrenos de propiedad del Estado.

La Gerencia Regional de Planeamiento, Presupuesto y Acondicionamiento Territorial, se encuentra a cargo de un Gerente Regional designado por el Gobernador Regional. Depende jerárquica y administrativamente del Gerente General Regional.

Constituyen unidades orgánicas dependientes de la Gerencia Regional de Planeamiento, Presupuesto y Acondicionamiento Territorial, las siguientes:

• Sub Gerencia de Planeamiento y Cooperación Técnica Internacional.
• Sub Gerencia de Presupuesto y Tributación.
• Sub Gerencia de Acondicionamiento Territorial.
• Sub Gerencia de Desarrollo Institucional.
• Sub Gerencia de Programación e Inversión Pública.