La actual estructura orgánica del Gobierno Regional Cajamarca, fue aprobada mediante la ORDENANZA REGIONAL N° D000001-2021-GRC-CR de fecha 24 de marzo del 2021, de acuerdo con las disposiciones legales vigente y en amparo del artículo 9 inciso a) de la Ley Orgánica de Gobiernos Regionales Ley Nº 27867, donde se dispone que los Gobiernos Regionales son competentes para aprobar su organización interna.

Es necesario indicar que la actual estructura orgánica es el resultado de haber modificado la anterior que estuvo vigente el año 2017, dadas las condiciones y para un mejor funcionamiento del Gobierno Regional.